RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612980.4

RDM1-215, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDM1, Length 501 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-215	ENST00000612980	SLC35E2	P0CK97	266 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	NID1	P14543	1247 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	MAG	P20916	626 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	GAL	P22466	123 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	MSX1	P28360	303 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	HTR1F	P30939	366 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SOX6	P35712	828 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ACTR1B	P42025	376 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	MTNR1A	P48039	350 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	WNT4	P56705	351 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TAS2R41	P59536	307 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ACTR1A	P61163	376 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	LTB4R	Q15722	352 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	MAPK14	Q16539	360 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	DUSP5	Q16690	384 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	MED25	Q71SY5	747 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ABHD13	Q7L211	337 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CA13	Q8N1Q1	262 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CDS1	Q92903	461 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TIMP4	Q99727	224 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	COQ7	Q99807	217 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	FN3K	Q9H479	309 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980		A0A0J9YY10	115 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	BHLHE40	O14503	412 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	TBX1	O43435	398 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	FGF17	O60258	216 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RDM1-215	ENST00000612980	CTNS	O60931	367 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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