RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 NUBPLQ8TB37 319 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 MFSD3Q96ES6 412 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 SOX7Q9BT81 388 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 TRMOQ9BU70 441 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 DGCR6LQ9BY27 220 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 P2RY12Q9H244 342 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 ING3Q9NXR8 418 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 PHF11Q9UIL8 331 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 FKBP7Q9Y680 259 aa10.42□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 UPK1AO00322 258 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 NDUFS4O43181 175 aa10.41□□□□□ -0.74
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HCG18-241ENST00000602290 SLC22A5O76082 557 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 APRTP07741 180 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 RAP2AP10114 183 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 SRP14P37108 136 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 PIK3CBP42338 1070 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 KCNJ5P48544 419 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 HSD17B7P56937 341 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 HILS1P60008 231 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 PCDH1Q08174 1060 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 CD47Q08722 323 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 ASAH1Q13510 395 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 PWP1Q13610 501 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 ARMCX4Q5H9R4 360 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 NCMAPQ5T1S8 102 aa10.41□□□□□ -0.74
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HCG18-241ENST00000602290 WFDC8Q8IUA0 241 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 OR5L2Q8NGL0 311 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 UFD1Q92890 307 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 HYLS1Q96M11 299 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 WDFY2Q96P53 400 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
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HCG18-241ENST00000602290 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 SLC22A4Q9H015 551 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 NTN4Q9HB63 628 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 PLSCR3Q9NRY6 295 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 MAT2BQ9NZL9 334 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 MBD2Q9UBB5 411 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 RNF112Q9ULX5 631 aa10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.4□□□□□ -0.74
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HCG18-241ENST00000602290 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 CDK5R2Q13319 367 aa10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 EFR3AQ14156 821 aa10.4□□□□□ -0.74
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HCG18-241ENST00000602290 NTRK2Q16620 822 aa10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 CLLU1Q5K131 121 aa10.4□□□□□ -0.74
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HCG18-241ENST00000602290 ZNF470Q6ECI4 717 aa10.4□□□□□ -0.74
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HCG18-241ENST00000602290 TMEM151AQ8N4L1 468 aa10.4□□□□□ -0.74
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HCG18-241ENST00000602290 OR14A16Q8NHC5 309 aa10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 NT5CQ8TCD5 201 aa10.4□□□□□ -0.74
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HCG18-241ENST00000602290 PTP4A1Q93096 173 aa10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 TESCQ96BS2 214 aa10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 CERS2Q96G23 380 aa10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 SMIM10Q96HG1 83 aa10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 NSMCE2Q96MF7 247 aa10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 GNRHR2Q96P88 292 aa10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 SIGLEC11Q96RL6 698 aa10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 MBOAT4Q96T53 435 aa10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
HCG18-241ENST00000602290 NTMT1Q9BV86 223 aa10.4□□□□□ -0.74
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