RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 MED20Q9H944 212 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 NEK6Q9HC98 313 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 MCCC2Q9HCC0 563 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE7BQ9NP56 450 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 STARD5Q9NSY2 213 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 FLRT3Q9NZU0 649 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 NINQ8N4C6 2090 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 MYO9BQ13459 2157 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM172BPA6NC97 362 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 CENPXA8MT69 81 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF879B4DU55 563 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 F8W735 103 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 J3QLW9 94 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 GPRIN2O60269 458 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 GATBO75879 557 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 OR7A10O76100 309 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 CSF2P04141 144 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 IFNA16P05015 189 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF19P17023 458 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 PTNP21246 168 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 S1PR1P21453 382 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 CD27P26842 260 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 HLA-DMAP28067 261 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 GRK6P43250 576 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 NR4A2P43354 598 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR3P46089 330 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC6A8P48029 635 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB25P57735 213 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1CAP62136 330 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 PITPNAQ00169 270 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 FUT7Q11130 342 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 IL10RAQ13651 578 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC58Q4VC31 144 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 VASNQ6EMK4 673 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATC1Q76KD6 591 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 BCORP1Q8N888 145 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 OR5M3Q8NGP4 307 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 ART5Q96L15 291 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 PTCHD1Q96NR3 888 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 SOSTQ9BQB4 213 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF32Q9H0A6 362 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 OR10A5Q9H207 317 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 EXTL2Q9UBQ6 330 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087WUJ7 227 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM30A4D0T7 59 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 B4DXG7 233 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 SCDO00767 359 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 IMPA2O14732 288 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 PDCD5O14737 125 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 RGS13O14921 159 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 ARPC3O15145 178 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 LYRM1O43325 122 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXS1O43638 330 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 SSX4O60224 188 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 REM1O75628 298 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 NCR1O76036 304 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 CHRNB1P11230 501 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 UBL4AP11441 157 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 SRFP11831 508 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 FUT1P19526 365 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 SSTR4P31391 388 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-222ENST00000592408 RORAP35398 523 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms