RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 OR4E2Q8NGC2 313 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 OR5D16Q8NGK9 328 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 KLK6Q92876 244 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 UBE2FQ969M7 185 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 GIMAP5Q96F15 307 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 C10orf90Q96M02 699 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CMTM3Q96MX0 182 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 LRRC61Q9BV99 259 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 OR51E2Q9H255 320 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 AMBNQ9NP70 447 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 RHCGQ9UBD6 479 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CBLCQ9ULV8 474 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 MED31Q9Y3C7 131 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CDHR4A6H8M9 788 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 UNC119BA6NIH7 251 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 HSPB2A8KAH6 182 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 LMO7DNF2Z398 122 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 PGRMC2O15173 223 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ZNF749O43361 778 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 PRAMEF2O60811 474 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 GPX5O75715 221 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 HLA-DQB1P01920 261 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 MT-ND5P03915 603 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 UGT2B7P16662 529 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 NR4A1P22736 598 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SLC6A6P31641 620 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 GCGRP47871 477 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CENPAP49450 140 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CCL11P51671 97 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CHRNEQ04844 493 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 FUT5Q11128 374 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 MAP4K2Q12851 820 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SERTAD2Q14140 314 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 FAM53BQ14153 422 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 HSPB2Q16082 182 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 TCTE1Q5JU00 501 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 DCST2Q5T1A1 773 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 AGAP6Q5VW22 663 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 RTL4Q6ZR62 310 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 MED25Q71SY5 747 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 VN1R4Q7Z5H5 301 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 RAB43Q86YS6 212 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ZNF527Q8NB42 609 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 FANK1Q8TC84 345 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 TMEM239Q8WW34 195 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 BMFQ96LC9 184 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 AGAP4Q96P64 663 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 OR2A14Q96R47 310 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 OR5M11Q96RB7 305 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 MNTQ99583 582 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 NDC1Q9BTX1 674 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 XKR8Q9H6D3 395 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CMC2Q9NRP2 79 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 FGF21Q9NSA1 209 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 COPZ2Q9P299 210 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 PRODH2Q9UF12 536 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 ANKRD12Q6UB98 2062 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 CCDC182A6NF36 153 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-218ENST00000584243 FABP12A6NFH5 140 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms