RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 EMC3Q9P0I2 261 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 OSGIN1Q9UJX0 560 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 IFT52Q9Y366 437 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ITPR3Q14573 2671 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PP18 115 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM72A0PK05 275 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CDHR4A6H8M9 788 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ANGPT2O15123 496 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ADAM11O75078 769 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PGM3O95394 542 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PMS2P2O95744 297 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 THBS1P07996 1170 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 FPR1P21462 350 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 VHLP40337 213 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RPS6KA3P51812 740 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 MAP2K6P52564 334 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35A1P78382 337 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 MXRA7P84157 204 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CDK6Q00534 326 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PLAURQ03405 335 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.238e-9■■■□□ 15.5
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PTPRM-214ENST00000583153 MAPK11Q15759 364 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 STK11Q15831 433 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 BEX5Q5H9J7 111 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 GCNT6Q5T4J0 391 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 NFKBIDQ8NI38 313 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 BBS10Q8TAM1 723 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PIGXQ8TBF5 258 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RNF217Q8TC41 542 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 S100PBPQ96BU1 408 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 OR10A4Q9H209 315 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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PTPRM-214ENST00000583153 NGBQ9NPG2 151 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS50Q9UI38 385 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 DSPPQ9NZW4 1301 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PPR1 153 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CIB4A0PJX0 185 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF724A8MTY0 619 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 C3orf80F5H4A9 247 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 FAAHO00519 579 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 GPR171O14626 319 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF208O43345 1280 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 FRS3O43559 492 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRM-214ENST00000583153 ATE1O95260 518 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-9P01782 118 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 THBDP07204 575 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRM-214ENST00000583153 PRG2P13727 222 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ETS2P15036 469 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A2P23975 617 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 IDUAP35475 653 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 OR3A2P47893 321 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 NR1H2P55055 460 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 BNIP2Q12982 314 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CEACAM7Q14002 265 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 KRT72Q14CN4 511 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 P2RY6Q15077 328 aa7.38□□□□□ -1.23
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