RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 AADACL4Q5VUY2 407 aa5.95□□□□□ -1.46
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CAPN3-210ENST00000561817 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 ULK3Q6PHR2 472 aa5.95□□□□□ -1.46
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CAPN3-210ENST00000561817 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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CAPN3-210ENST00000561817 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
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CAPN3-210ENST00000561817 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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CAPN3-210ENST00000561817 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 VHLLQ6RSH7 139 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 C19orf48Q6RUI8 117 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-210ENST00000561817 DHRS13Q6UX07 377 aa5.94□□□□□ -1.46
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