RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 KLHL9Q9P2J3 617 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 KLHL13Q9P2N7 655 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 CHP2O43745 196 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 NPIPB7O75200 414 aa16.85■□□□□ 0.29
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RABGGTA-208ENST00000558954 GRNP28799 593 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
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RABGGTA-208ENST00000558954 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 VWA1Q6PCB0 445 aa16.85■□□□□ 0.29
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RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGAP24Q8N264 748 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 OR4D11Q8NGI4 311 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 OR6K3Q8NGY3 331 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 PIGXQ8TBF5 258 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa16.85■□□□□ 0.29
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RABGGTA-208ENST00000558954 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
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RABGGTA-208ENST00000558954 A0A087WUJ7 227 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 LIPT2A6NK58 231 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 MSTNO14793 375 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 CYTIPO60759 359 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
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RABGGTA-208ENST00000558954 SERPINA1P01009 418 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 T-ENOLP0DO92 83 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 IMPDH2P12268 514 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 NCK1P16333 377 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 TNFRSF1BP20333 461 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 AGTR1P30556 359 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 CDH12P55289 794 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 FXNQ16595 210 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM201Q5SNT2 666 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 DEF8Q6ZN54 512 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 CBLL1Q75N03 491 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 STARD4Q96DR4 205 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-208ENST00000558954 JKAMPQ9P055 326 aa16.84■□□□□ 0.29
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RABGGTA-208ENST00000558954 C19orf84I3L1E1 186 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 UBOX5O94941 541 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 FPR1P21462 350 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 OR1E2P47887 323 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 TAS2R41P59536 307 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 H3F3AP84243 136 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 EGR4Q05215 589 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 CEACAM7Q14002 265 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 OR7A5Q15622 319 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 GLYATQ6IB77 296 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 PAQR6Q6TCH4 344 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 BTLAQ7Z6A9 289 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 VTCN1Q7Z7D3 282 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 LUZP2Q86TE4 346 aa16.83■□□□□ 0.28
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RABGGTA-208ENST00000558954 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 HSH2DQ96JZ2 352 aa16.83■□□□□ 0.28
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RABGGTA-208ENST00000558954 PSD2Q9BQI7 771 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM43Q9BTV4 400 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 C1orf21Q9H246 121 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 BCO1Q9HAY6 547 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC7A7Q9UM01 511 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 PROCRQ9UNN8 238 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 IFNW1P05000 195 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 CD8BP10966 210 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 KLK2P20151 261 aa16.82■□□□□ 0.28
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RABGGTA-208ENST00000558954 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 RPS5P46782 204 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 PDK3Q15120 406 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 IFI44LQ53G44 452 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM69AQ5T7M9 428 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 RINLQ6ZS11 566 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 FKBP9P1Q75LS8 142 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 TUSC5Q8IXB3 177 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 MFSD8Q8NHS3 518 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 MPP4Q96JB8 637 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-208ENST00000558954 GORASP2Q9H8Y8 452 aa16.82■□□□□ 0.28
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