RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-215ENST00000557654 CARNMT1Q8N4J0 409 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 NHLRC2Q8NBF2 726 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 OR2T34Q8NGX1 318 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 OR2T3Q8NH03 318 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 LILRB4Q8NHJ6 448 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 MR1Q95460 341 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 NRBF2Q96F24 287 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 RNF157Q96PX1 679 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 CPXM1Q96SM3 734 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 FBXO8Q9NRD0 319 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 NARFQ9UHQ1 456 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 ZNF639Q9UID6 485 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 NRAPQ86VF7 1730 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 MYH11P35749 1972 aa3.65□□□□□ -1.82
GPHN-215ENST00000557654 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.65□□□□□ -1.83
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GPHN-215ENST00000557654 BBIP1A8MTZ0 92 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 CFLARO15519 480 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 MED7O43513 233 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 GMNNO75496 209 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 CLN5O75503 358 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 CABYRO75952 493 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 MYO1DO94832 1006 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 APRTP07741 180 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 UMPSP11172 480 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 HSD17B1P14061 328 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 TNNI1P19237 187 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 FASP25445 335 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 MIPP30301 263 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 KRT6CP48668 564 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 GABARAPL2P60520 117 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 GNA12Q03113 381 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 PSMD5Q16401 504 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 PTPN20Q4JDL3 420 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 IQCCQ4KMZ1 466 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 SMUG1Q53HV7 270 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 BOLA3Q53S33 107 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 SPANXN3Q5MJ09 141 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 PPM1LQ5SGD2 360 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 CCNJQ5T5M9 372 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 PRMT9Q6P2P2 845 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 PRSS48Q7RTY5 328 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 LINC00523Q86TU6 105 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 DHFR2Q86XF0 187 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 ERO1BQ86YB8 467 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 CPNE9Q8IYJ1 553 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 DHRSXQ8N5I4 330 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 PQLC3Q8N755 202 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 ARL10Q8N8L6 244 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 JOSD2Q8TAC2 188 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 ARNTL2Q8WYA1 636 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 ROPN1LQ96C74 230 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 GLT1D1Q96MS3 346 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 RDH12Q96NR8 316 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.833e-7■■■■■ 30
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GPHN-215ENST00000557654 CIB1Q99828 191 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 SH3GL1Q99961 368 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 FAM213AQ9BRX8 229 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 ZNF670Q9BS34 389 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 CNPY3Q9BT09 278 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 NDEL1Q9GZM8 345 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 CUTCQ9NTM9 273 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 GDAP2Q9NXN4 497 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 TIMM22Q9Y584 194 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 STRCQ7RTU9 1775 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 PTPRJQ12913 1337 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 DHRS12A0PJE2 317 aa3.64□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 PRORSD1PA6NEY8 169 aa3.64□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 SAGE2PA6NJ88 616 aa3.64□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 EVPLLA8MZ36 301 aa3.64□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 HACD1B0YJ81 288 aa3.64□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 SDHDO14521 159 aa3.64□□□□□ -1.83
GPHN-215ENST00000557654 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
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