RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FOXN2P32314 431 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDAP32320 146 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PMELP40967 661 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LHX1P48742 406 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLCN3P51790 818 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CTSWP56202 376 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MS4A2Q01362 244 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FGFBP1Q14512 234 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAPK14Q16539 360 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PTGISQ16647 500 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CR1LQ2VPA4 569 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM42Q69YG0 159 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CARM1Q86X55 608 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EMC1Q8N766 993 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TGM7Q96PF1 710 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCNA7Q96RP8 456 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYADMQ96S97 322 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DPH7Q9BTV6 452 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BFARQ9NZS9 450 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 USP22Q9UPT9 525 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LEUTXA8MZ59 168 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANHXE9PGG2 379 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H7C2Y5 167 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SULT1C2O00338 296 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BTN3A3O00478 584 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SIGLEC5O15389 551 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CYBBP04839 570 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR10J4P0C629 311 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLURP2P0DP57 97 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAP2AP10114 183 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VPREB1P12018 145 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GYPEP15421 78 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAX1P15863 534 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF23P17027 643 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FPR3P25089 353 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GKP32189 559 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CSKP41240 450 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GNPDA1P46926 289 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB7AP51149 207 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PTTG1IPP53801 180 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NXPH1P58417 271 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBE2KP61086 200 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EMX2Q04743 252 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZP4Q12836 540 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TCF15Q12870 199 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATP6V1FQ16864 119 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SAXO2Q658L1 398 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM198Q66K66 360 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q7L0L9 218 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SSX7Q7RTT5 188 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SATL1Q86VE3 508 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB43Q86YS6 212 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR51F2Q8NH61 342 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TLCD1Q96CP7 247 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms