RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519342.1

RNF19A-204, Transcript of ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene RNF19A, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF19A-204	ENST00000519342	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342		A0A1B0GWA3	101 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	FRS3	O43559	492 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	KDELR2	P33947	212 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	TLE4	Q04727	773 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	CEACAM7	Q14002	265 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	OR1Q1	Q15612	314 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	SSX8	Q7RTT4	187 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	OR10A4	Q9H209	315 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	ALG2	Q9H553	416 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	LIPT2	A6NK58	231 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	OPN1SW	P03999	348 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	SLC7A2	P52569	658 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	SLC16A1	P53985	500 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	H3F3A	P84243	136 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	HOXC5	Q00444	222 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	LIPE	Q05469	1076 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	P2RY6	Q15077	328 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	OR7A5	Q15622	319 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	NRF1	Q16656	503 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	OR6S1	Q8NH40	331 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	MPP4	Q96JB8	637 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	C12orf49	Q9H741	205 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	MED12	Q93074	2177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	DOCK7	Q96N67	2140 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342		A0A087WUJ7	227 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342		A0A0B4J2E0	115 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342		A0A1B0GX12	115 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	SH3D21	A4FU49	640 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	UGT2B10	P36537	528 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	PSME3	P61289	254 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	SELENOW	P63302	87 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	MXRA7	P84157	204 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	FAM27E3	Q08E93	113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	SPATS1	Q496A3	300 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	TAMM41	Q96BW9	452 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	MED18	Q9BUE0	208 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	ADA2	Q9NZK5	511 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	RASD1	Q9Y272	281 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	AQP7P3	A6NL99	342 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	CHP2	O43745	196 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	NPIPB7	O75200	414 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	IMPDH2	P12268	514 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	OR3A2	P47893	321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	BNIP2	Q12982	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNF19A-204	ENST00000519342		Q6ZT83	130 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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