RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 RPS5P46782 204 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 MAP2K6P52564 334 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 MS4A2Q01362 244 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 IL1RL1Q01638 556 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 OR7A5Q15622 319 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 FXNQ16595 210 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf140Q5VVS0 124 aa12.01□□□□□ -0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 GCNT2Q8N0V5 402 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa12.01□□□□□ -0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa12.01□□□□□ -0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 J3KTA2 159 aa12□□□□□ -0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 DLX5P56178 289 aa12□□□□□ -0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC35A1P78382 337 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 ST3GAL3Q11203 375 aa12□□□□□ -0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 STK35Q8TDR2 534 aa11.99□□□□□ -0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 CLCF1Q9UBD9 225 aa11.99□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC7A8Q9UHI5 535 aa11.99□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 POMPQ9Y244 141 aa11.99□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 TESMINQ9Y4I5 508 aa11.99□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0G2JNJ9 132 aa11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
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