RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A3Q00325 362 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 EPS8Q12929 822 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 GNA13Q14344 377 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF385BQ569K4 471 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 DOK4Q8TEW6 326 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 OR7D2Q96RA2 312 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MECRQ9BV79 373 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 VPS11Q9H270 941 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MED29Q9NX70 200 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 HAO1Q9UJM8 370 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TACC2O95359 2948 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 UGT2B17O75795 530 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SNAP29O95721 258 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 PROCP04070 461 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 GAAP10253 952 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 UQCRC2P22695 453 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 NR4A1P22736 598 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SLC1A3P43003 542 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 LMO4P61968 165 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SLC3A1Q07837 685 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZAR1Q86SH2 424 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 NEURL3Q96EH8 262 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 PHF21BQ96EK2 531 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 NPAS1Q99742 590 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CALML5Q9NZT1 146 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 HIVEP2P31629 2446 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ESYT3A0FGR9 886 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CIB4A0PJX0 185 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SH3BGRLO75368 114 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TGFAP01135 160 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TFPTP0C1Z6 253 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 GCAP28676 217 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF83P51522 516 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CLDN8P56748 225 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MYBPC1Q00872 1141 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 HGFACQ04756 655 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 IMPG1Q17R60 797 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 LIPMQ5VYY2 423 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SCAIQ8N9R8 606 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 KIF18AQ8NI77 898 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 OIP5O43482 229 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CHEK2O96017 543 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 OR4A8P0C604 315 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF250P15622 560 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CBX1P83916 185 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 STX5Q13190 355 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 RETREG3Q86VR2 466 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CDS1Q92903 461 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 OR5B2Q96R09 309 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CMAHPQ9Y471 501 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TMPRSS2O15393 492 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SUPT7LO94864 414 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 IMPDH2P12268 514 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SPOCK1Q08629 439 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SEPHS2Q99611 448 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.65□□□□□ -1.34
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