RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	ICAM4	Q14773	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	QPRT	Q15274	297 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MREG	Q8N565	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	JADE3	Q92613	823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ARL5B	Q96KC2	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR51I1	Q9H343	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	HIVEP2	P31629	2446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CYTIP	O60759	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SMPD2	O60906	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LYZL6	O75951	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	FES	P07332	822 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ITGA5	P08648	1049 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	UBL4A	P11441	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	BGN	P21810	368 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SOAT1	P35610	550 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CDKN1A	P38936	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	P2RY4	P51582	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SESN3	P58005	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	EMX2	Q04743	252 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TNK1	Q13470	666 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CASP8	Q14790	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	P2RY6	Q15077	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MISP	Q8IVT2	679 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OSTF1	Q92882	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RAB8B	Q92930	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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