RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-216ENST00000493752 GLI4P10075 376 aa7.29□□□□□ -1.24
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ABCD4-216ENST00000493752 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.29□□□□□ -1.24
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ABCD4-216ENST00000493752 CYTIPO60759 359 aa7.27□□□□□ -1.25
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ABCD4-216ENST00000493752 AQP8O94778 261 aa7.27□□□□□ -1.25
ABCD4-216ENST00000493752 TOXO94900 526 aa7.27□□□□□ -1.25
ABCD4-216ENST00000493752 VAMP5O95183 116 aa7.27□□□□□ -1.25
ABCD4-216ENST00000493752 GADD45GO95257 159 aa7.27□□□□□ -1.25
ABCD4-216ENST00000493752 IL2RAP01589 272 aa7.27□□□□□ -1.25
ABCD4-216ENST00000493752 CRHP06850 196 aa7.27□□□□□ -1.25
ABCD4-216ENST00000493752 FUT4P22083 530 aa7.27□□□□□ -1.25
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