RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 TACR3P29371 465 aa15.27■□□□□ 0.04
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TOM1-216ENST00000492723 ERVK-25P63136 954 aa15.27■□□□□ 0.04
TOM1-216ENST00000492723 DNASE1L3Q13609 305 aa15.27■□□□□ 0.04
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TOM1-216ENST00000492723 PRR23CQ6ZRP0 262 aa15.27■□□□□ 0.04
TOM1-216ENST00000492723 CCDC190Q86UF4 302 aa15.27■□□□□ 0.04
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TOM1-216ENST00000492723 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
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TOM1-216ENST00000492723 TRIM36Q9NQ86 728 aa15.26■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa15.26■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
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TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PQD3 144 aa15.25■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.25■□□□□ 0.03
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TOM1-216ENST00000492723 RANBP1P43487 201 aa15.25■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 ZNF85Q03923 595 aa15.25■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 STEAP3Q658P3 488 aa15.25■□□□□ 0.03
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TOM1-216ENST00000492723 ACTC1P68032 377 aa15.25■□□□□ 0.03
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TOM1-216ENST00000492723 DAB2P98082 770 aa15.25■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.25■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 C1orf210Q8IVY1 113 aa15.25■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 NPEPL1Q8NDH3 523 aa15.25■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 C17orf47Q8NEP4 570 aa15.25■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 OR5W2Q8NH69 310 aa15.25■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 METTL21AQ8WXB1 218 aa15.25■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 C4orf36Q96KX1 117 aa15.25■□□□□ 0.03
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