RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490051.1

GRB10-222, Transcript of growth factor receptor bound protein 10, human

TSL 4

Gene GRB10, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRB10-222	ENST00000490051	DDIT4L	Q96D03	193 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	FBXO17	Q96EF6	278 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	PANX1	Q96RD7	426 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	CENPH	Q9H3R5	247 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	CHODL	Q9H9P2	273 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	POLE3	Q9NRF9	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	CCDC154	A6NI56	674 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	DNPH1	O43598	174 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	IFNA2	P01563	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	TUBA1B	P68363	451 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	TUBA4A	P68366	448 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	SLC35A1	P78382	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	H3F3A	P84243	136 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	CEACAM7	Q14002	265 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	CARTPT	Q16568	116 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	SMU1	Q2TAY7	513 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	TUBA1A	Q71U36	451 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	CADM2	Q8N3J6	435 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	CCDC115	Q96NT0	180 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	MUS81	Q96NY9	551 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	ZIM3	Q96PE6	472 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	MOK	Q9UQ07	419 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	AGAP5	A6NIR3	686 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051		H7C417	338 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	NR2F1	P10589	423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	SLC25A16	P16260	332 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	IL7R	P16871	459 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	HTR3A	P46098	478 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	VLDLR	P98155	873 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	BST1	Q10588	318 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	EPS8	Q12929	822 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	MPP2	Q14168	576 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	GGTLC2	Q14390	218 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	SLC17A1	Q14916	467 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF544	Q6NX49	715 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	SSX8	Q7RTT4	187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	AAED1	Q7RTV5	226 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	VRK2	Q86Y07	508 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	AIG1	Q9NVV5	245 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRB10-222	ENST00000490051	CFAP73	A6NFT4	308 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	LIPT2	A6NK58	231 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	SDHD	O14521	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF208	O43345	1280 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	LGI1	O95970	557 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	BCHE	P06276	602 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	PGR	P06401	933 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	GUSB	P08236	651 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	FAM157C	P0CG43	387 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	PRG2	P13727	222 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	ETFA	P13804	333 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	IGFBP5	P24593	272 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	CXCR1	P25024	350 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	MPG	P29372	298 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	SLC1A3	P43003	542 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	SELENOP	P49908	381 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	MAPK11	Q15759	364 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	GTDC1	Q4AE62	458 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	VHLL	Q6RSH7	139 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRB10-222	ENST00000490051	LINGO2	Q7L985	606 aa		11.14	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms