RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488601.6

POLR1C-208, Transcript of RNA polymerase I and III subunit C, human

TSL 2

Gene POLR1C, Length 973 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1C-208	ENST00000488601	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RBBP8	Q99708	897 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CA10	Q9NS85	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601		A0A1W2PQ09	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	LYZL6	O75951	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR2C1	O95371	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	NTN1	O95631	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TNNI3	P19429	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PSMB5	P28074	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PRLHR	P49683	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TUBA4A	P68366	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SLAMF1	Q13291	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	IRF3	Q14653	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	NTRK2	Q16620	822 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CADM3	Q8N126	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	DPH7	Q9BTV6	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RHOD	O00212	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	DFFA	O00273	331 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SLC16A8	O95907	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	UCHL3	P15374	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	DES	P17661	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	GGT1	P19440	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SRD5A2	P31213	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CD80	P33681	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	AIF1	P55008	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PRAME	P78395	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CDR2	Q01850	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RELA	Q04206	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PHKG1	Q16816	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	AVPI1	Q5T686	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	FAM110B	Q8TC76	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POLR1C-208	ENST00000488601	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601		A8MZ25	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POLR1C-208	ENST00000488601	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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