RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 CYB561A3Q8NBI2 242 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 KCT2Q8NC54 265 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 THEM6Q8WUY1 208 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SUSD6Q92537 303 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 WNT2BQ93097 391 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CAMK1GQ96NX5 476 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 TAS2R5Q9NYW4 299 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 IL20Q9NYY1 176 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SCN3AQ9NY46 2000 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 GRXCR1A8MXD5 290 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 PLPP2O43688 288 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ECDO95905 644 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ZNF806P0C7X5 589 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 C8orf89P0DMQ9 161 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 H2BFSP57053 126 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 TMEM17Q86X19 198 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 GID4Q8IVV7 300 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 NAXDQ8IW45 347 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 OR5J2Q8NH18 312 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ASB16Q96NS5 453 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 BBS4Q96RK4 519 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 GLIPR2Q9H4G4 154 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD19PQ9H560 264 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 OPN4Q9UHM6 478 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CDHR4A6H8M9 788 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CDC42EP2O14613 210 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 BMP7P18075 431 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 HCCSP53701 268 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CSNK1G2P78368 415 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 REEP5Q00765 189 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 DHODHQ02127 395 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 STX4Q12846 297 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 MAPK14Q16539 360 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 C2orf68Q2NKX9 166 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 TP53I3Q53FA7 332 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 FCRLAQ7L513 359 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CBLN2Q8IUK8 224 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 FGF13Q92913 245 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 TIMP4Q99727 224 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 BIN3Q9NQY0 253 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SPEGQ15772 3267 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 OR2M5A3KFT3 312 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 OR6C65A6NJZ3 312 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 LINC00587B1AMM8 73 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 F5H5P2 479 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CLUP10909 449 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ZNF620Q6ZNG0 422 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 RAB11FIP2Q7L804 512 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 LURAP1LQ8IV03 231 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 NANPQ8TBE9 248 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 C16orf58Q96GQ5 468 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 OR14A2Q96R54 314 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 DPH1Q9BZG8 443 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 NDRG3Q9UGV2 375 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 KCNE3Q9Y6H6 103 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 NARSO43776 548 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 OR2A4O95047 310 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SLC35G4P0C7Q5 338 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CPN1P15169 458 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ART1P52961 327 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 S100A12P80511 92 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SERTAD2Q14140 314 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ZNF626Q68DY1 528 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 NIPAL3Q6P499 406 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 NUDT13Q86X67 352 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 OR52L1Q8NGH7 329 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 OR4D10Q8NGI6 311 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 OR2A7Q96R45 310 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 MCHR1Q99705 422 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SLC19A3Q9BZV2 496 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A18Q9H1K4 315 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CTSFQ9UBX1 484 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 MPTX1A8MV57 137 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ARL6IP5O75915 188 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SSR2P43308 183 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 KCNJ3P48549 501 aa12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms