RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487500.2

RPL7-208, Transcript of ribosomal protein L7, human

TSL 1 (best)

Gene RPL7, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell body (neuron), Dendrite .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL7-208	ENST00000487500	BCKDK	O14874	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	ARPC3	O15145	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	CFLAR	O15519	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	OR10H3	O60404	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	AVIL	O75366	819 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	ZWINT	O95229	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	ACSL3	O95573	720 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	GBA	P04062	536 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	CEACAM3	P40198	252 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	VEGFC	P49767	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	ATP5J2	P56134	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	MYL7	Q01449	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	IRF8	Q02556	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	CHRNB3	Q05901	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	TFDP2	Q14188	446 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	SELPLG	Q14242	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	PDGFRL	Q15198	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	GRK1	Q15835	563 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	MARC1	Q5VT66	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	DEFB119	Q8N690	84 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	DDB2	Q92466	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	OMD	Q99983	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	FZD8	Q9H461	694 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	ABCB9	Q9NP78	766 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	GLTP	Q9NZD2	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500		K7EQS6	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	CDC7	O00311	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	PEX12	O00623	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	FLRT2	O43155	660 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF208	O43345	1280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	SLC37A4	O43826	429 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	UGT1A9	O60656	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	ADAP1	O75689	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	EDN1	P05305	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	IFI30	P13284	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	HLA-E	P13747	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	GSTM3	P21266	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	MATN1	P21941	496 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	DUSP1	P28562	367 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	MPG	P29372	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL7-208	ENST00000487500	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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