RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-211ENST00000486161 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
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PTPRD-211ENST00000486161 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CLDN24A6NM45 220 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ENTPD6O75354 484 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 GALK2Q01415 458 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 FUT7Q11130 342 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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PTPRD-211ENST00000486161 FTMTQ8N4E7 242 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 SARAFQ96BY9 339 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRD-211ENST00000486161 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRD-211ENST00000486161 ATP1A4Q13733 1029 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF691Q5VV52 312 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRD-211ENST00000486161 ODF4Q2M2E3 257 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRD-211ENST00000486161 OR4C3Q8NH37 302 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 OR8K3Q8NH51 312 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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PTPRD-211ENST00000486161 TUBA1BP68363 451 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRD-211ENST00000486161 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 MOKQ9UQ07 419 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 FITM1A5D6W6 292 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ALG1L2C9J202 215 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRD-211ENST00000486161 EMDP50402 254 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRD-211ENST00000486161 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 KLBQ86Z14 1044 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRD-211ENST00000486161 LRFN5Q96NI6 719 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 FKRPQ9H9S5 495 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.57□□□□□ -1.2
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