RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	ADAM19	Q9H013	955 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	FAM107B	Q9H098	131 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	MRGBP	Q9NV56	204 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	FAM221A	A4D161	298 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF724	A8MTY0	619 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880		A8MVM7	634 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	GPR171	O14626	319 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	TPST1	O60507	370 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	RAMP1	O60894	148 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	AHSA1	O95433	338 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	RAF1	P04049	648 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PTN	P21246	168 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	OR3A2	P47893	321 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	REP15	Q6BDI9	236 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	OR10A6	Q8NH74	314 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	C3orf49	Q96BT1	292 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PRR14	Q9BWN1	585 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	SAR1A	Q9NR31	198 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	UPB1	Q9UBR1	384 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ACAN	P16112	2415 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	CIB4	A0PJX0	185 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF716	A6NP11	495 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	FBP2	O00757	339 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	DNPH1	O43598	174 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	THBD	P07204	575 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	CBL	P22681	906 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	EDNRA	P25101	427 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PCYT1A	P49585	367 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	MAP2K6	P52564	334 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	TESK1	Q15569	626 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	BEX5	Q5H9J7	111 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM225	Q6GV28	225 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PTOV1	Q86YD1	416 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	P3H2	Q8IVL5	708 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM99	Q8N816	258 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GWA3	101 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPR1	153 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	LIPT2	A6NK58	231 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880		M0R3H8	397 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	CLOCK	O15516	846 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	SIAH2	O43255	324 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	KRT33A	O76009	404 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	RBBP4	Q09028	425 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	FAP	Q12884	760 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	P2RY6	Q15077	328 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ADRM1	Q16186	407 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	RABL3	Q5HYI8	236 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZT83	130 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	COMTD1	Q86VU5	262 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	NINJ1	Q92982	152 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	SH3GL1	Q99961	368 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM2	Q9C040	744 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		13.11	□□□□□ -0.31

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