RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464263.1

RAB11FIP3-208, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RAB11FIP3, Length 329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF613	Q6PF04	617 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LUZP2	Q86TE4	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ELOA3	Q8NG57	546 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PROX1	Q92786	737 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CDRT15	Q96T59	188 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	BCO1	Q9HAY6	547 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		A0A087WUJ7	227 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		B2RBV5	119 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GSTA4	O15217	222 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LYPD3	O95274	346 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	THY1	P04216	161 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	YES1	P07947	543 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CD8B	P10966	210 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GGT1	P19440	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	AGTR1	P30556	359 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IDUA	P35475	653 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CDH12	P55289	794 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CTBP2	P56545	445 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CEACAM7	Q14002	265 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PDK3	Q15120	406 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FXN	Q16595	210 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CBLL1	Q75N03	491 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CARM1	Q86X55	608 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CCDC103	Q8IW40	242 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RNF148	Q8N7C7	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NDE1	Q9NXR1	346 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF716	A6NP11	495 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RAMP1	O60894	148 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GPI	P06744	558 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HSD17B1	P14061	328 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NCK1	P16333	377 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CALB2	P22676	271 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR1E2	P47887	323 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR7A5	Q15622	319 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GLYAT	Q6IB77	296 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RINL	Q6ZS11	566 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TAAR8	Q969N4	342 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LRRC46	Q96FV0	321 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TPD52L3	Q96J77	140 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SELENON	Q9NZV5	590 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PROCR	Q9UNN8	238 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF724	A8MTY0	619 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FZD7	O75084	574 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SERPINA1	P01009	418 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	COX6B1	P14854	86 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	UQCRC1	P31930	480 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PCYT1A	P49585	367 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SLC16A1	P53985	500 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MXRA7	P84157	204 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		13.7	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms