RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PYURFQ96I23 114 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CNBD2Q96M20 576 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RLIMQ9NVW2 624 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SLC7A8Q9UHI5 535 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TUBAL3A6NHL2 446 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ALG1L2C9J202 215 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 LRRTM2O43300 516 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 FCMRO60667 390 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TBX19O60806 448 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV3-9P01782 118 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 C8BP07358 591 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SLC1A3P43003 542 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 DAP3P51398 398 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CLDN17P56750 224 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 IL5RAQ01344 420 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 VEZF1Q14119 521 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC58Q4VC31 144 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 VHLLQ6RSH7 139 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 POM121Q96HA1 1249 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NODALQ96S42 347 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 APOL4Q9BPW4 351 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 FKRPQ9H9S5 495 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CHST11Q9NPF2 352 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 MED17Q9NVC6 651 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 POLEQ07864 2286 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 J3QRK9 145 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ICMTO60725 284 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 EDN3P14138 238 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 EMDP50402 254 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 VLDLRP98155 873 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 FOXF1Q12946 379 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 S100A13Q99584 98 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CHID1Q9BWS9 393 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 AHRRA9YTQ3 701 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TNFSF11O14788 317 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ARPC2O15144 300 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NME2P1O60361 137 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 DIRAS1O95057 198 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PRG2P13727 222 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NME2P22392 152 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GCH1P30793 250 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 APLNRP35414 380 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 OR1Q1Q15612 314 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ELP5Q8TE02 316 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CRELD1Q96HD1 420 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 FRMD6Q96NE9 622 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SLC7A7Q9UM01 511 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SPG11Q96JI7 2443 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 MED26O95402 600 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CRYZL1O95825 349 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 HSMCR30P0CW71 290 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RAP2AP10114 183 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 MYL12AP19105 171 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CDKN2CP42773 168 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SLC15A1P46059 708 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GABRA4P48169 554 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 IST1P53990 364 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RAC1P63000 192 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 EPS8Q12929 822 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NTRK2Q16620 822 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SLC36A3Q495N2 470 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 C4orf46Q504U0 113 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SERPINA11Q86U17 422 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 C17orf47Q8NEP4 570 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM239Q8WW34 195 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 S100A14Q9HCY8 104 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.43□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms