RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC1A3P43003 542 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2B6P58173 313 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 STX3Q13277 289 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINGO2Q7L985 606 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSX8Q7RTT4 187 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CMIPQ8IY22 773 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM99Q8N816 258 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 VPS33AQ96AX1 596 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM45BQ96B21 275 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUCL1Q96DR8 90 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 BOD1Q96IK1 185 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 PARD6BQ9BYG5 372 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 NELFAQ9H3P2 528 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASB6Q9NWX5 421 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB21Q9UL25 225 aa7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CIB4A0PJX0 185 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDHR4A6H8M9 788 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 LIPT2A6NK58 231 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 H7C417 338 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 M0R1B8 84 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR171O14626 319 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 FRS3O43559 492 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 FZD7O75084 574 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPIPB7O75200 414 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 LY6HO94772 140 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 AKR7A3O95154 331 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ETFAP13804 333 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEA8P43361 318 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 HTR3AP46098 478 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35A1P78382 337 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 EGR4Q05215 589 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 LGALS3BPQ08380 585 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 BNIP2Q12982 314 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRF1Q16656 503 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MST1LQ2TV78 715 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGAP6Q5VW22 663 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CASP12Q6UXS9 341 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 COMTD1Q86VU5 262 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 C10orf111Q8N326 155 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUC15Q8N387 334 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF525Q8N782 197 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELOA3Q8NG57 546 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR9I1Q8NGQ6 314 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARL8AQ96BM9 186 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 RADILQ96JH8 1075 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR52E6Q96RD3 313 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 PANX1Q96RD7 426 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALG2Q9H553 416 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa7.39□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM120BA0PK00 339 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFAP73A6NFT4 308 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 AQP7P3A6NL99 342 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 VWC2LB2RUY7 222 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 HDAC3O15379 428 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCHEP06276 602 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 DBIP07108 87 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUDT7P0C024 238 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 TFPTP0C1Z6 253 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL7RP16871 459 aa7.38□□□□□ -1.23
GAPDHP28-201ENST00000455134 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms