RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 OR52N1Q8NH53 320 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 EDAQ92838 391 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 NOX3Q9HBY0 568 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 ACAD8Q9UKU7 415 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 I6L893 689 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 SSX4O60224 188 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 BRINP1O60477 761 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 TSPAN12O95859 305 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 APOC1P02654 83 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 MAS1P04201 325 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 CASP6P55212 293 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 S100A10P60903 97 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 TPBGQ13641 420 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 DCST2Q5T1A1 773 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 LHX8Q68G74 356 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 UEVLDQ8IX04 471 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 HORMAD2Q8N7B1 307 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 NXPE3Q969Y0 559 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 PARPBPQ9NWS1 579 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 A0A1B0GVC2 190 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 A6NIN4 97 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 CHP2O43745 196 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 RAD51DO75771 328 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 SCO1O75880 301 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 CPMP14384 443 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 ZNF28P17035 718 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 GRK5P34947 590 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 TSPAN31Q12999 210 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 VNN2O95498 520 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 FBXO45P0C2W1 286 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 PNMTP11086 282 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 UBL4AP11441 157 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 SLC6A8P48029 635 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 TGM4P49221 684 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 ECH1Q13011 328 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 BAMBIQ13145 260 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 POGLUT1Q8NBL1 392 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 OR4F15Q8NGB8 312 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 NINJ1Q92982 152 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 KIF25Q9UIL4 384 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 H3BNC9 293 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 SULT2B1O00204 365 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 AIFM1O95831 613 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 UBBP0CG47 229 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 S100A11P31949 105 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 PRPS1P60891 318 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 UBA52P62987 128 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 FOXK1P85037 733 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 NR0B2Q15466 257 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 SYT14P1Q58G82 188 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 SVBPQ8N300 66 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 TCEAL3Q969E4 200 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 DDIT4LQ96D03 193 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 PKMYT1Q99640 499 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 PBX4Q9BYU1 374 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 FGF21Q9NSA1 209 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 CUTCQ9NTM9 273 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 A0A0A6YYJ9 748 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 F8W036 122 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 BLOC1S1P78537 153 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-209ENST00000446688 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.1 ms