RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CGREF1	Q99674	301 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	VAPA	Q9P0L0	249 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ZAN	Q9Y493	2812 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028		B2RBV5	119 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	RNF223	E7ERA6	249 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SULT2B1	O00204	365 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	KIAA0513	O60268	411 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	DNAJA2	O60884	412 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CRLF1	O75462	422 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	LYZL6	O75951	148 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	NPPA	P01160	153 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CRAT	P43155	626 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	DIO1	P49895	249 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	KHK	P50053	298 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SESN3	P58005	492 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	MERTK	Q12866	999 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SYT14P1	Q58G82	188 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	RNF130	Q86XS8	419 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SH3GL1	Q99961	368 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	REG4	Q9BYZ8	158 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TRIM2	Q9C040	744 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ACER3	Q9NUN7	267 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PRSS50	Q9UI38	385 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	DPRX	A6NFQ7	191 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	HMGN4	O00479	90 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	GPR171	O14626	319 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	DNPH1	O43598	174 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	UGT2B17	O75795	530 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	H6PD	O95479	791 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	GUSB	P08236	651 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	OR12D1	P0DN82	309 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	COX5A	P20674	150 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CDKN1A	P38936	164 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	MTPN	P58546	118 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	FAP	Q12884	760 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PDK3	Q15120	406 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	NRF1	Q16656	503 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	C10orf111	Q8N326	155 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF563	Q8TA94	476 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	NDE1	Q9NXR1	346 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	OR5H1	A6NKK0	313 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	FCMR	O60667	390 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CHRM4	P08173	479 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	TFPI	P10646	304 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	CDH11	P55287	796 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PSME3	P61289	254 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	HPCA	P84074	193 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	MAPK11	Q15759	364 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	AGAP6	Q5VW22	663 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG11-208	ENST00000437028	PIGX	Q8TBF5	258 aa		13.63	□□□□□ -0.23

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