RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
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RPS3AP54-201ENST00000435535 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.98□□□□□ -1.77
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAET1LQ5VY80 246 aa3.98□□□□□ -1.77
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