RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428313.5

C9orf3-206, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 2,288 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-206ENST00000428313 FBXO32Q969P5 355 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 HAVCR1Q96D42 359 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 MED8Q96G25 268 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 TAAR9Q96RI9 348 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 SPSB2Q99619 263 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 BCL2L10Q9HD36 194 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 A0A1B0GTI1 187 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 CDHR4A6H8M9 788 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 FAM183AA6NL82 134 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 IFITM5A6NNB3 132 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF879B4DU55 563 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 FADS1O60427 444 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 TBX19O60806 448 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 CD1AP06126 327 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 CSF1P09603 554 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ITGA3P26006 1051 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 TMEM244Q5VVB8 128 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 CHST9Q7L1S5 443 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 GPR142Q7Z601 462 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 SDR9C7Q8NEX9 313 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 OR56A3Q8NH54 315 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 RNF141Q8WVD5 230 aa14.85□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 PPM1DO15297 605 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 KLK1P06870 262 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 CASRP41180 1078 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 RBP2P50120 134 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 TAS2R20P59543 309 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 RHOAP61586 193 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF85Q03923 595 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ST3GAL3Q11203 375 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 DECR1Q16698 335 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 C4orf46Q504U0 113 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 RPTNQ6XPR3 784 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 FCRLAQ7L513 359 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 REC114Q7Z4M0 266 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 OR5J2Q8NH18 312 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 SMPDL3AQ92484 453 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 SMIM19Q96E16 107 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 FBXO17Q96EF6 278 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 TUBA4BQ9H853 241 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 COMMD9Q9P000 198 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.84□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 A0A1W2PPK0 400 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 OR2AT4A6NND4 320 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 H7C417 338 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 B4GALT2O60909 372 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 MELTFP08582 738 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 OR4Q2P0C623 313 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 CALCBP10092 127 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 NR2F1P10589 423 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 OR12D2P58182 307 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ACTC1P68032 377 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ACTA1P68133 377 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 RPE65Q16518 533 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 SYNPRQ8TBG9 265 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 DIO2Q92813 273 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 SUSD3Q96L08 255 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.83□□□□□ -0.03
C9orf3-206ENST00000428313 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.83□□□□□ -0.04
C9orf3-206ENST00000428313 SULT2B1O00204 365 aa14.83□□□□□ -0.04
C9orf3-206ENST00000428313 EMC8O43402 210 aa14.83□□□□□ -0.04
C9orf3-206ENST00000428313 TGM5O43548 720 aa14.83□□□□□ -0.04
C9orf3-206ENST00000428313 RBBP9O75884 186 aa14.83□□□□□ -0.04
C9orf3-206ENST00000428313 LY86O95711 162 aa14.83□□□□□ -0.04
C9orf3-206ENST00000428313 RD3LP0DJH9 198 aa14.83□□□□□ -0.04
C9orf3-206ENST00000428313 NQO2P16083 231 aa14.83□□□□□ -0.04
C9orf3-206ENST00000428313 CDK2P24941 298 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms