RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
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RBM39-211ENST00000426951 OPN1MWP04001 364 aa2.75□□□□□ -1.97
RBM39-211ENST00000426951 IGHV4-34P06331 123 aa2.75□□□□□ -1.97
RBM39-211ENST00000426951 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RBM39-211ENST00000426951 OPN1MW2P0DN77 364 aa2.75□□□□□ -1.97
RBM39-211ENST00000426951 OPN1MW3P0DN78 364 aa2.75□□□□□ -1.97
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RBM39-211ENST00000426951 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
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RBM39-211ENST00000426951 TNFSF13O75888 250 aa2.74□□□□□ -1.97
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RBM39-211ENST00000426951 C11orf71Q6IPW1 123 aa2.74□□□□□ -1.97
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RBM39-211ENST00000426951 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RBM39-211ENST00000426951 CASC10Q5T4H9 136 aa2.73□□□□□ -1.97
RBM39-211ENST00000426951 OR2G6Q5TZ20 316 aa2.73□□□□□ -1.97
RBM39-211ENST00000426951 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa2.73□□□□□ -1.97
RBM39-211ENST00000426951 Q6ZN92 141 aa2.73□□□□□ -1.97
RBM39-211ENST00000426951 ACP7Q6ZNF0 438 aa2.73□□□□□ -1.97
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