RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 RCN3Q96D15 328 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF583Q96ND8 569 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 MED18Q9BUE0 208 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 EVA1AQ9H8M9 152 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM27Q9HBJ8 222 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 EMC3Q9P0I2 261 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR52Q9Y2T5 361 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GWA3 101 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF716A6NP11 495 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 SNX3O60493 162 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 TPST2O60704 377 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 RAMP1O60894 148 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 C8BP07358 591 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 CCKARP32238 428 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 OR3A2P47893 321 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 GNGT1P63211 74 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 OR1Q1Q15612 314 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf140Q5VVS0 124 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXW10Q5XX13 1052 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 C22orf34Q6ZV56 151 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC80Q76M96 950 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC26A7Q8TE54 656 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 TAPBPLQ9BX59 468 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 HDHD5Q9BXW7 423 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 C12orf10Q9HB07 376 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF226Q9NYT6 803 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM229AB2RXF0 380 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR171O14626 319 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 AIM2O14862 343 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 NPIPB7O75200 414 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAP00813 363 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC16A1P53985 500 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ELOA3BQ3SY89 546 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ULK3Q6PHR2 472 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 PAQR6Q6TCH4 344 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC20BQ86Y33 519 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 TREML1Q86YW5 311 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF100Q8IYN0 542 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 GABRG1Q8N1C3 465 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM99Q8N816 258 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ELOA3Q8NG57 546 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR32P1Q8NGA4 272 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGDIGQ99819 225 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 MYLK2Q9H1R3 596 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 EFCAB1Q9HAE3 211 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 USP22Q9UPT9 525 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 AKR7A3O95154 331 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 GOSR1O95249 250 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 PNMTP11086 282 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP3CBP16298 524 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 EDNRAP25101 427 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 NTF4P34130 210 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 NCALDP61601 193 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 EGR4Q05215 589 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ALG10BQ5I7T1 473 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ERICH5Q6P6B1 374 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 C6orf89Q6UWU4 347 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 TAMM41Q96BW9 452 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC47A1Q96FL8 570 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ADPRHL2Q9NX46 363 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 SELENONQ9NZV5 590 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 PRSS50Q9UI38 385 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-204ENST00000416021 LRBAP50851 2863 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CCT8L1PA6NM43 557 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 M0R3H8 397 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 HRGP04196 525 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CD247P20963 164 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 VEZF1Q14119 521 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC17A1Q14916 467 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 P2RY6Q15077 328 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 NRF1Q16656 503 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 SFRP5Q5T4F7 317 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM91A1Q658Y4 838 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 MFSD8Q8NHS3 518 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF217Q8TC41 542 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 NRGNQ92686 78 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC38A4Q969I6 547 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A36Q96CQ1 311 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 MCHR1Q99705 422 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 ACTR6Q9GZN1 396 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10A4Q9H209 315 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CMTM6Q9NX76 183 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 TACC2O95359 2948 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 MPDZO75970 2070 aa18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.5 ms