RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410938.1

RNU6-1328P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1328, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1328P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FRRS1Q6ZNA5 592 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DNM1P46Q6ZS02 220 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C9orf139Q6ZV77 190 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FRA10AC1Q70Z53 315 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ARCQ7LC44 396 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C16orf82Q7Z2V1 217 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CMC1Q7Z7K0 106 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM72BQ86X60 149 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CMTM8Q8IZV2 173 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TPRX1Q8N7U7 411 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LYPD6BQ8NI32 183 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF519Q8TB69 540 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NRGNQ92686 78 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TOMM40LQ969M1 308 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CATSPER2Q96P56 530 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OPALINQ96PE5 141 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CYP2S1Q96SQ9 504 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CYTH2Q99418 400 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LGMNQ99538 433 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MEIS3Q99687 375 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC29A1Q99808 456 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OVOL2Q9BRP0 275 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SYT11Q9BT88 431 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GBA3Q9H227 469 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RHBGQ9H310 441 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 UGT1A10Q9HAW8 530 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SPACA1Q9HBV2 294 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 INPP5EQ9NRR6 644 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 EHFQ9NZC4 300 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KCNIP1Q9NZI2 227 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SENP1Q9P0U3 644 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SCML2Q9UQR0 700 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NTNG1Q9Y2I2 539 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C15orf41Q9Y2V0 281 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MYH15Q9Y2K3 1946 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 EVPLQ92817 2033 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GLTPD2A6NH11 291 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRPC5OSA6NMA1 111 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ARHGEF33A8MVX0 844 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NR5A2O00482 541 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GPAA1O43292 621 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LALBAP00709 142 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HPP00738 406 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IFNW1P05000 195 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRIM49P0CI25 452 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRIM49CP0CI26 452 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DPEP1P16444 411 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF3P17036 446 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CD82P27701 267 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HTR1FP30939 366 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NTSP30990 170 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CD80P33681 288 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DCTP40126 519 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OPRL1P41146 370 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LEPP41159 167 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 XCR1P46094 333 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RPL34P49207 117 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ARHGDIBP52566 201 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TMEM50BP56557 158 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PSMC5P62195 406 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF85Q03923 595 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF154Q13106 437 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLAQ13239 276 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ITPK1Q13572 414 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RCAN2Q14206 197 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MTF1Q14872 753 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ABRAXAS2Q15018 415 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MAPRE2Q15555 327 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PPP1R3AQ16821 1122 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MICAQ29983 383 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C14orf28Q4W4Y0 310 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C1orf220Q5T0J3 134 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ARMCX5Q6P1M9 558 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TMEM220Q6QAJ8 160 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C19orf48Q6RUI8 117 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PAQR6Q6TCH4 344 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SPESP1Q6UW49 350 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1328P-201ENST00000410938 Q6ZSR9 355 aa2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms