RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 C3orf33Q6P1S2 294 aa26.65■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 WDR88Q6ZMY6 472 aa26.65■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 PRSS27Q9BQR3 290 aa26.65■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa26.65■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 POFUT2Q9Y2G5 429 aa26.65■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa26.65■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF556Q9HAH1 456 aa26.65■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 VASNQ6EMK4 673 aa26.64■■□□□ 1.85
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF555Q8NEP9 628 aa26.64■■□□□ 1.85
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC16A6O15403 523 aa26.63■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 ADAP00813 363 aa26.63■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 SEC23BQ15437 767 aa26.63■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa26.63■■□□□ 1.85
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ECHS1-201ENST00000368547 OR9Q2Q8NGE9 314 aa26.63■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 CNBD2Q96M20 576 aa26.63■■□□□ 1.85
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNHIT1O43257 154 aa26.62■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 SHC1P29353 583 aa26.62■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 SFTPDP35247 375 aa26.62■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 LHX2P50458 406 aa26.62■■□□□ 1.85
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ECHS1-201ENST00000368547 P3H2Q8IVL5 708 aa26.61■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 AQP11Q8NBQ7 271 aa26.61■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 TIMP4Q99727 224 aa26.61■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF426Q9BUY5 554 aa26.61■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
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ECHS1-201ENST00000368547 IL18R1Q13478 541 aa26.61■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 UBQLNLQ8IYU4 475 aa26.61■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 DDIT4LQ96D03 193 aa26.61■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 GRIP2Q9C0E4 1043 aa26.61■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 UBAP1Q9NZ09 502 aa26.61■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa26.6■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 A8MVM7 634 aa26.6■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 SEC14L5O43304 696 aa26.6■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 OR10H3O60404 316 aa26.6■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 PRB1P04280 392 aa26.6■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 TFPIP10646 304 aa26.6■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 IFNGR2P38484 337 aa26.6■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 EGR4Q05215 589 aa26.6■■□□□ 1.85
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ECHS1-201ENST00000368547 GGNQ86UU5 652 aa26.6■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 OR4K5Q8NGD3 323 aa26.6■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa26.6■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 NPIPA2E9PIF3 369 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 E9PQ18 207 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 NPIPA3F8WFD2 350 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 H0YC42 278 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 GASTP01350 101 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF708P17019 499 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 CLDN18P56856 261 aa26.59■■□□□ 1.85
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