RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 BCO1Q9HAY6 547 aa6.81□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.81□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 EMC3Q9P0I2 261 aa6.81□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.81□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CDHR4A6H8M9 788 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP73A6NFT4 308 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF724A8MTY0 619 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 FAAHO00519 579 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 DNPH1O43598 174 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 PMS2P2O95744 297 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 IFNA14P01570 189 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 THBS1P07996 1170 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 TFPTP0C1Z6 253 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 COX4I1P13073 169 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ETS2P15036 469 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 GPX2P18283 190 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CD53P19397 219 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CCNA2P20248 432 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 IL32P24001 234 aa6.8□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 OR3A2P47893 321 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 BEX5Q5H9J7 111 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 RNF220Q5VTB9 566 aa6.8□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 REP15Q6BDI9 236 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 REEP3Q6NUK4 255 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.8□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINA11Q86U17 422 aa6.8□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 HIPK4Q8NE63 616 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.8□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 OR10A4Q9H209 315 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.8□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.8□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 ARID1AO14497 2285 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.79□□□□□ -1.32
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SGMS1-201ENST00000361543 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 TACR3P29371 465 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 MAP2K6P52564 334 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 NR1H2P55055 460 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 OR2B6P58173 313 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 COPZ1P61923 177 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 CDK6Q00534 326 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 P2RY6Q15077 328 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 TSC22D1Q15714 1073 aa6.79□□□□□ -1.32
SGMS1-201ENST00000361543 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.79□□□□□ -1.32
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