RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 SEPHS2Q99611 448 aa18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 VKORC1Q9BQB6 163 aa18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 PRSS27Q9BQR3 290 aa18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 NDUFAF4Q9P032 175 aa18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 RIMS3Q9UJD0 308 aa18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 MEMO1Q9Y316 297 aa18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 C2CD3Q4AC94 2353 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 CD8B2A6NJW9 211 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 FFAR1O14842 300 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 CIB2O75838 187 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 PMS2P2O95744 297 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 RHCEP18577 417 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 MAGEA2P43356 314 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 DIO1P49895 249 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 ST3GAL3Q11203 375 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 MYBPHQ13203 477 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 C1orf146Q5VVC0 180 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 RPTNQ6XPR3 784 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 TMPPEQ6ZT21 453 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 ADGRG5Q8IZF4 528 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 TMEM43Q9BTV4 400 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF426Q9BUY5 554 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 SRXN1Q9BYN0 137 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 POTEKPQ9BYX7 375 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 CALHM2Q9HA72 323 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 IL1RAPQ9NPH3 570 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF175Q9Y473 711 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 DOCK7Q96N67 2140 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 CCL21O00585 134 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 AHSA1O95433 338 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 CLDN1O95832 211 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 GPIP06744 558 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 UMPSP11172 480 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 IDUAP35475 653 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 RAC3P60763 192 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 CHRNB3Q05901 458 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 PON3Q15166 354 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 SGCBQ16585 318 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 C1orf140Q5VVS0 124 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 MYO7BQ6PIF6 2116 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 SPATA24Q86W54 205 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 MARVELD2Q8N4S9 558 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 OSTF1Q92882 214 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 FNDC11Q9BVV2 318 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 TIGARQ9NQ88 270 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
RALGPS1-202ENST00000319107 DHRS12A0PJE2 317 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 SULT2B1O00204 365 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 DNPH1O43598 174 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 ZG16O60844 167 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 FZD7O75084 574 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 IMPDH2P12268 514 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 PTNP21246 168 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 RBM34P42696 430 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 CARD18P57730 90 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 PLXDC2Q6UX71 529 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 SEM1Q6ZVN7 128 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 NKAIN4Q8IVV8 208 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 PIK3C3Q8NEB9 887 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 CANT1Q8WVQ1 401 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 DNAJA3Q96EY1 480 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 EPYCQ99645 322 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 PIP5K1AQ99755 562 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 TTYH2Q9BSA4 534 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 PTDSS2Q9BVG9 487 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 ANKRD19PQ9H560 264 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 RHCGQ9UBD6 479 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 TRAPPC4Q9Y296 219 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC22A20A6NK97 555 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 DIRAS1O95057 198 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 SYNGR4O95473 234 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 RAP2AP10114 183 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 FCGR2AP12318 317 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 NUP107P57740 925 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 TRAM2Q15035 370 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 TMEM211Q6ICI0 200 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 FNDC9Q8TBE3 224 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 TMEM255BQ8WV15 326 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 WNT2BQ93097 391 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-202ENST00000319107 DHRS1Q96LJ7 313 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms