RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC15A5A6NIM6 579 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 EEDO75530 441 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 LIMK1P53667 647 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 SP3Q02447 781 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 P2RY14Q15391 338 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 DPPA4Q7L190 304 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC29A3Q9BZD2 475 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR10A2Q9H208 303 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PREPP48147 710 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PPP1CBP62140 327 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM166BA8MTA8 275 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 GLUD1P00367 558 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PPOXP50336 477 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 UNC50Q53HI1 259 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TRIM77I1YAP6 450 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 IL12RB2Q99665 862 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 BCL9LQ86UU0 1499 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR5K4A6NMS3 321 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 MATN3O15232 486 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TAS2R60P59551 318 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 HIST1H3AP68431 136 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PXDC1Q5TGL8 231 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 MUL1Q969V5 352 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 HCAR1Q9BXC0 346 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR4Q2P0C623 313 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR4F6Q8NGB9 312 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 HES4Q9HCC6 221 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 RAC1P63000 192 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TNFRSF17Q02223 184 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CTSL3PQ5NE16 218 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 FA2HQ7L5A8 372 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR13C4Q8NGS5 318 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC39A13Q96H72 371 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 WWTR1Q9GZV5 400 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR51F1A6NGY5 319 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 G6PDP11413 515 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 HTR1EP28566 365 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ELLP55199 621 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 NHLH1Q02575 133 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 NHLH2Q02577 135 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 AADACL3Q5VUY0 350 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 C11orf49Q9H6J7 331 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 FZD7O75084 574 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 LMO2P25791 158 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 MLF1P58340 268 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 APH1AQ96BI3 265 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 JMJD7P0C870 316 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TGFBR1P36897 503 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PARP16Q8N5Y8 322 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF558Q96NG5 402 aa10.5□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 BMP4P12644 408 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PROX2Q3B8N5 592 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 NUP37Q8NFH4 326 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PPP1R35Q8TAP8 253 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM239Q8WW34 195 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR20Q99678 358 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 FBXL2Q9UKC9 423 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TBX19O60806 448 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 NUDT3O95989 172 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 QDPRP09417 244 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TGM1P22735 817 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM88Q6PEY1 159 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TSLPQ969D9 159 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 DDIT4LQ96D03 193 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 B4GALT6Q9UBX8 382 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 GJE1A6NN92 205 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 DLX3O60479 287 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TACR3P29371 465 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 GABREP78334 506 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR137CQ8N3F9 429 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PCED1BQ96HM7 432 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TP53RKQ96S44 253 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PQ09 198 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 EPHX1P07099 455 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CLCNKAP51800 687 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PLEK2Q9NYT0 353 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 LIPCP11150 499 aa10.49□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR1D2P34982 312 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms