RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 HPGDP15428 266 aa17.6■□□□□ 0.41
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USP21-201ENST00000289865 PON3Q15166 354 aa17.6■□□□□ 0.41
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USP21-201ENST00000289865 TRAPPC2BP0DI82 140 aa17.6■□□□□ 0.41
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USP21-201ENST00000289865 SEC16AO15027 2179 aa17.58■□□□□ 0.4
USP21-201ENST00000289865 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa17.58■□□□□ 0.4
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USP21-201ENST00000289865 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa17.58■□□□□ 0.4
USP21-201ENST00000289865 SCDO00767 359 aa17.58■□□□□ 0.4
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