RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 CUTCQ9NTM9 273 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 MYH3P11055 1940 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 METTL15A6NJ78 407 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 I6L893 689 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 RAB33AQ14088 237 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 WBP2NLQ6ICG8 309 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 HHIPQ96QV1 700 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 ENKD1Q9H0I2 346 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 INPP5EQ9NRR6 644 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 C7orf72A4D263 438 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 TRAPPC2LH3BP13 241 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 CBR1P16152 277 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 CLDN10P78369 228 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 ILKQ13418 452 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 SGK3Q96BR1 496 aa16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 IMPA2O14732 288 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 PPP3CBP16298 524 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 NME2P22392 152 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 MAGEB1P43366 347 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 TTLL8A6PVC2 850 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 HACD4Q5VWC8 232 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 FAM234AQ9H0X4 552 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM82A0PJX8 343 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 NPC1O15118 1278 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 OR2T1O43869 369 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 ITGB7P26010 798 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF836Q6ZNA1 936 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 LANCL3Q6ZV70 420 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 C20orf27Q9GZN8 174 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.77■□□□□ 0.28
COL5A3-201ENST00000264828 CLDN24A6NM45 220 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF217O75362 1048 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 ALPLP05186 524 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 FCGR2AP12318 317 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 FAPQ12884 760 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 PLA2G7Q13093 441 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 PPP1R35Q8TAP8 253 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 SUSD2Q9UGT4 822 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 SLC5A2P31639 672 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 CHRNEQ04844 493 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF852Q6ZMS4 543 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 IDO2Q6ZQW0 420 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 RHOXF1Q8NHV9 184 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF480Q8WV37 535 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 DTD2Q96FN9 168 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 SLC6A20Q9NP91 592 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 PDLIM7Q9NR12 457 aa16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 SLC22A23A1A5C7 686 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 C2orf76Q3KRA6 126 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 OR51D1Q8NGF3 324 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 LGALS14Q8TCE9 139 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 NT5DC2Q9H857 520 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 E9PI62 339 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 ATP1B3P54709 279 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 TPRA1Q86W33 373 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 LINC01599Q8WXQ3 324 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 VN1R3Q9BXE9 311 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 D6RAR5 112 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 TUSC2O75896 110 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 CPMP14384 443 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 HOXA9P31269 272 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 TSFMP43897 325 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 KIR2DS3Q14952 304 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 FCRL1Q96LA6 429 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 OCSTAMPQ9BR26 566 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 KIF25Q9UIL4 384 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 FBXO7Q9Y3I1 522 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 IGHG1P01857 330 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 MGST1P10620 155 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 KITLGP21583 273 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 GABRA5P31644 462 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.76■□□□□ 0.27
COL5A3-201ENST00000264828 FAM213BQ8TBF2 198 aa16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms