RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GNT2Q9NY97 397 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPRSS11DO60235 418 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJB6O75190 326 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC3AO75596 197 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYZL1O95825 349 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 EPPINO95925 133 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGN1P05114 100 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 FPR3P25089 353 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 DCDP81605 110 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM214AQ32MH5 1076 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM35AQ53FP2 167 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4C11Q6IEV9 310 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 OR9A4Q8NGU2 314 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 NINQ8N4C6 2090 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 WASHC1A8K0Z3 465 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 M6PRP20645 277 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TALDO1P37837 337 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMKVQ8NCB2 501 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGUQ9H490 435 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 MCUBQ9NWR8 336 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 IL20Q9NYY1 176 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0A6YYD5 115 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JMP0 313 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SURF4O15260 269 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 NKX2-8O15522 239 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRM4P08173 479 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A1P30531 599 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 AHRP35869 848 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAM1Q15629 374 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 DECR1Q16698 335 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD17B12Q53GQ0 312 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM209AQ5JX71 171 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SIGIRRQ6IA17 410 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5D16Q8NGK9 328 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8D4Q8NGM9 314 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSFQ9UBX1 484 aa24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 CELP19835 753 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 OMPP47874 163 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 CAV3P56539 151 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 IKZF1Q13422 519 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP40Q5TG30 622 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 LHFPL3Q86UP9 236 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC37A3Q8NCC5 494 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5M3Q8NGP4 307 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 TMED9Q9BVK6 235 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 ING4Q9UNL4 249 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JN53 185 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35G6P0C7Q6 338 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 AVPR1BP47901 424 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 RFX3P48380 749 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB8AP61006 207 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 COL28A1Q2UY09 1125 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 HBMQ6B0K9 141 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 GID4Q8IVV7 300 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC28AQ8IWP9 274 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SUN5Q8TC36 379 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 BBS4Q96RK4 519 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF649Q9BS31 505 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF32Q9H0A6 362 aa24.13■■□□□ 1.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 GPR52Q9Y2T5 361 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF860A6NHJ4 632 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 DHFRP00374 187 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 CXADRP78310 365 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ESCO2Q56NI9 601 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SZRD1Q7Z422 152 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 AMER3Q8N944 861 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 DIO2Q92813 273 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 HDHD5Q9BXW7 423 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL28Q9NXS3 571 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 C5AR2Q9P296 337 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa24.12■■□□□ 1.45
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