RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 CHP2O43745 196 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 AKR7A3O95154 331 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CD36P16671 472 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CXCR1P25024 350 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ITGA3P26006 1051 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ALDH3B2P48448 385 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 NRG3P56975 720 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 FOXK2Q01167 660 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF141Q15928 474 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TSTQ16762 297 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 MEP1BQ16820 701 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 EIPR1Q53HC9 387 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF527Q8NB42 609 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 COG8Q96MW5 612 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 PITX2Q99697 317 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CENPOQ9BU64 300 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 MCCC2Q9HCC0 563 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1B0GVG6 124 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ADAM10O14672 748 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ARHGEF9O43307 516 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TRAPPC6AO75865 159 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ZFAND5O76080 213 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 MPZL1O95297 269 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 GADD45AP24522 165 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CTXN1P60606 82 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SQSTM1Q13501 440 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 FHL1Q13642 323 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 OR7A5Q15622 319 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SLX4IPQ5VYV7 408 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SSX6Q7RTT6 188 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM99Q8N816 258 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 OR10H4Q8NGA5 316 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 Q96MT0 163 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TRIM2Q9C040 744 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CLN6Q9NWW5 311 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 IL20Q9NYY1 176 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TPRKBQ9Y3C4 175 aa5.97□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 OR6C68A6NDL8 312 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ARGFXA6NJG6 315 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 E9PI62 339 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 J3QRK9 145 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CELA3AP09093 270 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 DBTP11182 482 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CASP3P42574 277 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 FMODQ06828 376 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 C3AR1Q16581 482 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF528Q3MIS6 628 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CARD17Q5XLA6 110 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CDK20Q8IZL9 346 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SLC37A3Q8NCC5 494 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 OR2T33Q8NG76 320 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TXNDC15Q96J42 360 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SYT4Q9H2B2 425 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TAS2R10Q9NYW0 307 aa5.96□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 A0A087WUJ7 227 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 NADKO95544 446 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SMSP52788 366 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 PRSS12P56730 875 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 NUP107P57740 925 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SMIM11AP58511 58 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 CDK5Q00535 292 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 TIGD6Q17RP2 521 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 PGGHGQ32M88 737 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 OR13C5Q8NGS8 318 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 LGALS12Q96DT0 336 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 RNFT2Q96EX2 444 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 RDH12Q96NR8 316 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 RACGAP1Q9H0H5 632 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 BRD7Q9NPI1 651 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 STMN3Q9NZ72 180 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 PINLYPA6NC86 204 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 FADS1O60427 444 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 PPM1BO75688 479 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SEC14L2O76054 403 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV3-9P01782 118 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 CCKBRP32239 447 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 PSMB10P40306 273 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 SRYQ05066 204 aa5.96□□□□□ -1.46
CNIH1-201ENST00000216416 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms