RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	P3H2	Q8IVL5	708 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	OR2T12	Q8NG77	320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	RNF128	Q8TEB7	428 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	DDIT4L	Q96D03	193 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	PROCR	Q9UNN8	238 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003	DOCK7	Q96N67	2140 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ARID1B-222	ENST00000637003		A8MXE2	369 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF208	O43345	1280 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	RAMP1	O60894	148 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	PRKD3	O94806	890 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	CGA	P01215	116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	IGFBP2	P18065	325 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	NCALD	P61601	193 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM27E3	Q08E93	113 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	OR1Q1	Q15612	314 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	CCDC80	Q76M96	950 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	CCDC103	Q8IW40	242 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	MICU2	Q8IYU8	434 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	LINC01560	Q8TB33	94 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	MCHR1	Q99705	422 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	PIGM	Q9H3S5	423 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	GALNT8	Q9NY28	637 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	DCTN3	O75935	186 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	PMS2P2	O95744	297 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM107A	O95990	144 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	FPR1	P21462	350 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	AGTR1	P30556	359 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	GSK3B	P49841	420 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	CEACAM7	Q14002	265 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	VEZF1	Q14119	521 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	OR7A5	Q15622	319 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	NRF1	Q16656	503 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	FITM2	Q8N6M3	262 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	RNF148	Q8N7C7	305 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC35B4	Q969S0	331 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF559	Q9BR84	538 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	TRIM2	Q9C040	744 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	MED12L	Q86YW9	2145 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003		A8MVM7	634 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	MSTN	O14793	375 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	CYTIP	O60759	359 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	NCK1	P16333	377 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	EDNRA	P25101	427 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	KDELR2	P33947	212 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	IDUA	P35475	653 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC25A3	Q00325	362 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	EGR4	Q05215	589 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ARID1B-222	ENST00000637003	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		13.5	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms