RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 FESP07332 822 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 UGT2B10P36537 528 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 KCNJ5P48544 419 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 STK32CQ86UX6 486 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 C11orf65Q8NCR3 313 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 RASSF1Q9NS23 344 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 ANGPT4Q9Y264 503 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 TESMINQ9Y4I5 508 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 C16orf97H3BN30 126 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 NPPAP01160 153 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 CCNA2P20248 432 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 CCKARP32238 428 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 CYP51A1Q16850 503 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 BEND4Q6ZU67 534 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 CADM2Q8N3J6 435 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 FANCFQ9NPI8 374 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 TMEM181Q9P2C4 612 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 PRORSD1PA6NEY8 169 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 SERPINB7O75635 380 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 KLK2P20151 261 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 CXCR1P25024 350 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 PDK3Q15120 406 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 C12orf49Q9H741 205 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 CAPN7Q9Y6W3 813 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-220ENST00000618056 ZNF724A8MTY0 619 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 FXYD1O00168 92 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 MMEL1Q495T6 779 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 NANOGP8Q6NSW7 305 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 TFAP2EQ6VUC0 442 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 SLC30A8Q8IWU4 369 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 C3orf49Q96BT1 292 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 LRRC58Q96CX6 371 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 POTEKPQ9BYX7 375 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 NANOGQ9H9S0 305 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 FRS3O43559 492 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 TPST1O60507 370 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 H3F3AP84243 136 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 REP15Q6BDI9 236 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 COMTD1Q86VU5 262 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 SNX32Q86XE0 403 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 OR8J3Q8NGG0 315 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 SH3GL1Q99961 368 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 MRASO14807 208 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 MFN2O95140 757 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 IMPDH2P12268 514 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 AQP1P29972 269 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 GZMMP51124 257 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 SLC35A1P78382 337 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 ZSCAN26Q16670 478 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 STAC2Q6ZMT1 411 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 ARMC8Q8IUR7 673 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 LSMEM1Q8N8F7 131 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 OR10A6Q8NH74 314 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 PIGXQ8TBF5 258 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 EVA1AQ9H8M9 152 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 LOC100653049A0A140TA62 436 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 GMNCA6NCL1 334 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 ZNF716A6NP11 495 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 NDUFAB1O14561 156 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 KRT34O76011 436 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 PCGF2P35227 344 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 SLC16A1P53985 500 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 OR2B6P58173 313 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 HOXC5Q00444 222 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 DNAJA3Q96EY1 480 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 MED18Q9BUE0 208 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 KLHL4Q9C0H6 718 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 EMC3Q9P0I2 261 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 ARMCX1Q9P291 453 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 ROS1P08922 2347 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 A8MVM7 634 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 TMEM229AB2RXF0 380 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 CASKO14936 926 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 C6orf89Q6UWU4 347 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 CDH24Q86UP0 819 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-220ENST00000618056 GABRG1Q8N1C3 465 aa22.1■■□□□ 1.13
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