RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 HTR3BO95264 441 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ETHE1O95571 254 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 OR13F1Q8NGS4 319 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL6Q9H0F7 186 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC6A20Q9NP91 592 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 OR2S2Q9NQN1 319 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 RP2O75695 350 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 METAP1P53582 386 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXK1P85037 733 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR50Q13585 617 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 MTFR2Q6P444 385 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 BEND4Q6ZU67 534 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFPM2Q8WW38 1151 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 MMP28Q9H239 520 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNS2Q9ULS6 477 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 POLHQ9Y253 713 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 GABRPO00591 440 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 SUSD5O60279 629 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 PET100P0DJ07 73 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 DESI1Q6ICB0 168 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ASB4Q9Y574 426 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM72A0PK05 275 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 DIRAS3O95661 229 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 IGHG1P01857 330 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 MMP11P24347 488 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 RADILQ96JH8 1075 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 H7C417 338 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 CD79AP11912 226 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 CD1CP29017 333 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 CAV3P56539 151 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 NMNAT3Q96T66 252 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ALG12Q9BV10 488 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 MRI1Q9BV20 369 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 PRDM9Q9NQV7 894 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 DCNP07585 359 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 P2RY14Q15391 338 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF749O43361 778 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 BMP4P12644 408 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 HSD17B7P56937 341 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 FGL2Q14314 439 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL6IP1Q15041 203 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 C3orf38Q5JPI3 329 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 AGBL4Q5VU57 503 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5M11Q96RB7 305 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB3AP20336 220 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 LSSP48449 732 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM150AQ86TG1 271 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 CTRCQ99895 268 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 CDH20Q9HBT6 801 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 DUSP22Q9NRW4 184 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 CEACAM5P06731 702 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ST6GAL1P15907 406 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 FPR3P25089 353 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXK2Q01167 660 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 NXNL2Q5VZ03 156 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC35D2Q76EJ3 337 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC35F3Q8IY50 421 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 SPAG16Q8N0X2 631 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5H2Q8NGV7 314 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR37Q9Y2I8 494 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 OR51B4Q9Y5P0 310 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 TEAD1P28347 426 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 DCAF12Q5T6F0 453 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 SAXO2Q658L1 398 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 FRMD1Q8N878 549 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ULBP2Q9BZM5 246 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1W2PQ09 198 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 HMGN4O00479 90 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 SOCS6O14544 535 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC58Q4VC31 144 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNPRQ8TBG9 265 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 C7orf34Q96L11 122 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB3DO95716 219 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF806P0C7X5 589 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ERP29P30040 261 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 SLX4IPQ5VYV7 408 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 OR51T1Q8NGJ9 327 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5D14Q8NGL3 314 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 UBQLN3Q9H347 655 aa19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms