RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 BEX5Q5H9J7 111 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 P3H2Q8IVL5 708 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 STEAP2Q8NFT2 490 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 GTF2H4Q92759 462 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 SPDL1Q96EA4 605 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 RAD21L1Q9H4I0 556 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 NPHS2Q9NP85 383 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 GPR52Q9Y2T5 361 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A096LPI6 279 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 FRS3O43559 492 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAJA2O60884 412 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SMPD2O60906 423 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 TGDSO95455 350 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PLAUP00749 431 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CXCR1P25024 350 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 EDNRAP25101 427 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PCYT1AP49585 367 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 MVDP53602 400 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SQLEQ14534 574 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 RGNQ15493 299 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 MAPK11Q15759 364 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CASP12Q6UXS9 341 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ADGRG3Q86Y34 549 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC103Q8IW40 242 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF440Q8IYI8 595 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 NFKBIDQ8NI38 313 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PIGXQ8TBF5 258 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PERPQ96FX8 193 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CXXC4Q9H2H0 198 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ARMC7Q9H6L4 198 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 BCO1Q9HAY6 547 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 GP6Q9HCN6 339 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 OSGIN1Q9UJX0 560 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CIB4A0PJX0 185 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CDHR4A6H8M9 788 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF814B7Z6K7 855 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 RAMP1O60894 148 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 RAD51DO75771 328 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PMS2P2O95744 297 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 TFPTP0C1Z6 253 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PRG2P13727 222 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 FPR1P21462 350 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 AQP1P29972 269 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 IDUAP35475 653 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC1A3P43003 542 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 MAGEA8P43361 318 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 OR3A2P47893 321 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 NR1H2P55055 460 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ADAM8P78325 824 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 HOXC5Q00444 222 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 BNIP2Q12982 314 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ITGADQ13349 1161 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 OR7A5Q15622 319 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 TAB1Q15750 504 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ACKR1Q16570 336 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 Q5PR19 223 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 C9orf135Q5VTT2 229 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SERPINA11Q86U17 422 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CLIP4Q8N3C7 705 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 BBS10Q8TAM1 723 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 APH1AQ96BI3 265 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 MBD6Q96DN6 1003 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 MAGEB18Q96M61 343 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms