RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 OR7G1Q8NGA0 311 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 FANK1Q8TC84 345 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52D1Q9H346 318 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 Q9N2J8 555 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 I3L1I5 382 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PIP5K1CO60331 668 aa23.31■■□□□ 1.32
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CAPNS1-204ENST00000587718 TIAF1O95411 115 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 LIMS3P0CW19 117 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 LIMS4P0CW20 117 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 GABRA5P31644 462 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SOX3P41225 446 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 IFITM3Q01628 133 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC13A2Q13183 592 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR50Q13585 617 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 DOC2BQ14184 412 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SPANXN2Q5MJ10 180 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 FIGNL1Q6PIW4 674 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R3BQ86XI6 285 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF440Q8IYI8 595 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SAMD8Q96LT4 415 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PDE7BQ9NP56 450 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PRODH2Q9UF12 536 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 BHLHE40O14503 412 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC42EP2O14613 210 aa23.31■■□□□ 1.32
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRG2P13727 222 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC1A3P43003 542 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 FGFBP1Q14512 234 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNAB1Q14722 419 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 KMT5CQ86Y97 462 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL36Q8N4N3 616 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 ITPKCQ96DU7 683 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 CNPPD1Q9BV87 410 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO34Q9NWN3 711 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 CBLCQ9ULV8 474 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 MMACHCQ9Y4U1 282 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 DLSTP36957 453 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP12AP54707 1039 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 RUNX1T1Q06455 604 aa23.3■■□□□ 1.32
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CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB110Q30KQ9 67 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 BPIFA2Q96DR5 249 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 MVB12AQ96EY5 273 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF167Q9H6Y7 350 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 CMC2Q9NRP2 79 aa23.3■■□□□ 1.32
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CAPNS1-204ENST00000587718 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
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CAPNS1-204ENST00000587718 TBXA2RP21731 343 aa23.29■■□□□ 1.32
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CAPNS1-204ENST00000587718 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa23.29■■□□□ 1.32
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CAPNS1-204ENST00000587718 SMARCD3Q6STE5 483 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00114Q6XXX2 140 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 QSOX2Q6ZRP7 698 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 LYSMD2Q8IV50 215 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 D2HGDHQ8N465 521 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PARP16Q8N5Y8 322 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC2A12Q8TD20 617 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SMURF1Q9HCE7 757 aa23.29■■□□□ 1.32
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CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 RARRES3Q9UL19 164 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SIGLEC7Q9Y286 467 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR52Q9Y2T5 361 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN16Q9Y5I7 305 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PTP4A3O75365 173 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PTTG1O95997 202 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 IGF2P01344 180 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 ZGLP1P0C6A0 271 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 GKN3PP0CG01 181 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 CD53P19397 219 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 RANBP1P43487 201 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PLAURQ03405 335 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 LIPKQ5VXJ0 399 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PAQR6Q6TCH4 344 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR88Q6ZMY6 472 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A46Q96AG3 418 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD7Q96MP8 289 aa23.28■■□□□ 1.32
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