RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 PCGF2P35227 344 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 PEX19P40855 299 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 DIO1P49895 249 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 OR2B6P58173 313 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 HOXC5Q00444 222 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 FCRLAQ7L513 359 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 SERPINA11Q86U17 422 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 STK32CQ86UX6 486 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 SLC43A2Q8N370 569 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 SMYD1Q8NB12 490 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ZNF524Q96C55 264 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ADGRG7Q96K78 797 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ZNF559Q9BR84 538 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 C12orf49Q9H741 205 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 RNF122Q9H9V4 155 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 FANCFQ9NPI8 374 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 GLRX2Q9NS18 164 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 TMEM72A0PK05 275 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 SYT5O00445 386 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 MSTNO14793 375 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 GSTA4O15217 222 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 DCTN3O75935 186 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 FESP07332 822 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 IDUAP35475 653 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 KIR2DL3P43628 341 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 NUDT2P50583 147 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 RAC3P60763 192 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 MXRA7P84157 204 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 PLAURQ03405 335 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 TFF3Q07654 80 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ADRM1Q16186 407 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 VMACQ2NL98 169 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 VWA1Q6PCB0 445 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 BIVMQ86UB2 503 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 PTOV1Q86YD1 416 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ELOA3Q8NG57 546 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ABHD3Q8WU67 409 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 PROX1Q92786 737 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 STARD4Q96DR4 205 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ARL5BQ96KC2 179 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 TRIM2Q9C040 744 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 GALNT8Q9NY28 637 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.95□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.94□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.94□□□□□ -1.3
SMG6-211ENST00000572369 A8MVM7 634 aa6.94□□□□□ -1.3
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