RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566286.5

TCF4-232, Transcript of transcription factor 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TCF4, Length 2,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4-232ENST00000566286 WDR26Q9H7D7 661 aa10.13□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 PLEKHA1Q9HB21 404 aa10.13□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 C12orf4Q9NQ89 552 aa10.13□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 NANSQ9NR45 359 aa10.13□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 MED9Q9NWA0 146 aa10.13□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 HAO2Q9NYQ3 351 aa10.13□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 SLC23A2Q9UGH3 650 aa10.13□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa10.13□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 WDR45Q9Y484 360 aa10.13□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 CDHR4A6H8M9 788 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 TBC1D3BA6NDS4 549 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ANTXRLA6NF34 631 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 RIIAD1A6NNX1 92 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 GATBO75879 557 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 TOXO94900 526 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 FGF19O95750 216 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 HPXP02790 462 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 THBS1P07996 1170 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ACSM4P0C7M7 580 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 DRD5P21918 477 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 PYCR1P32322 319 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 BCL6P41182 706 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 SELENOPP49908 381 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 CCR9P51686 369 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 METAP1P53582 386 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 OR12D2P58182 307 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 FXYD6P3P58550 94 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ZNF85Q03923 595 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ZNF77Q15935 545 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 TMEM52BQ4KMG9 183 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 NHLRC3Q5JS37 347 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 TCTE1Q5JU00 501 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 GARNL3Q5VVW2 1013 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ZNF836Q6ZNA1 936 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 OVCH1Q7RTY7 1134 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 HDDC3Q8N4P3 179 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 SPICQ8N5J4 248 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 KREMEN2Q8NCW0 462 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ZNF671Q8TAW3 534 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 TMEM239Q8WW34 195 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 OR8D1Q8WZ84 308 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 SMPDL3BQ92485 455 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 PTP4A1Q93096 173 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 SLC35A4Q96G79 324 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 MS4A4EQ96PG1 132 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 PRSS27Q9BQR3 290 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 OR51V1Q9H2C8 321 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ADGRL4Q9HBW9 690 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 COQ3Q9NZJ6 369 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 BAIAP2Q9UQB8 552 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 A0A1B0GTQ1 180 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 TRIM77I1YAP6 450 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 CCL16O15467 120 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 TFP02787 698 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 GIPP09681 153 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 CPN1P15169 458 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ZNF3P17036 446 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 NT5EP21589 574 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 RAB28P51157 221 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ZNF136P52737 540 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 DUSP8Q13202 625 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 TEAD2Q15562 447 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 C18orf63Q68DL7 685 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 MFSD12Q6NUT3 480 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 FAM198BQ6UWH4 519 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 C3P1Q6ZMU1 363 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 CHMP1BQ7LBR1 199 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 OR6V1Q8N148 313 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 BMPERQ8N8U9 685 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 OR11G2Q8NGC1 345 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 OR4D9Q8NGE8 314 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 OR2A1Q8NGT9 310 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 OR4C6Q8NH72 309 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 SMIM19Q96E16 107 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ZNF681Q96N22 645 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 CD93Q9NPY3 652 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 OR6C2Q9NZP2 312 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 KCMF1Q9P0J7 381 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 ACSL5Q9ULC5 683 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 WNT6Q9Y6F9 365 aa10.12□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 A0A1W2PRG6 482 aa10.11□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 RHPN2P1A8MT19 583 aa10.11□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 C4orf51C9J302 202 aa10.11□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 OGG1O15527 345 aa10.11□□□□□ -0.79
TCF4-232ENST00000566286 CXCL14O95715 111 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms