RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556210.1

CUX1-215, Transcript of cut like homeobox 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CUX1, Length 4,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-215	ENST00000556210	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	E2F1	Q01094	437 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	SLC6A18	Q96N87	628 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	LMF1	Q96S06	567 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	PIGU	Q9H490	435 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	NIPAL2	Q9H841	368 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	CDH23	Q9H251	3354 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	SVIL	O95425	2214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	HMGA2	P52926	109 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	TSPAN5	P62079	268 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	FAM209A	Q5JX71	171 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ZAR1	Q86SH2	424 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	BTBD2	Q9BX70	525 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	PDE7B	Q9NP56	450 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210		M0R233	179 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	NDUFB2	O95178	105 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	C1QB	P02746	253 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	HSF2	Q03933	536 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ZP2	Q05996	745 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	IRF3	Q14653	427 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ZNF79	Q15937	498 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	SMUG1	Q53HV7	270 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ESCO2	Q56NI9	601 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	GPAT4	Q86UL3	456 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210		Q96M85	177 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	TEAD3	Q99594	435 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	TMEM72	A0PK05	275 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	COMMD7	Q86VX2	200 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	SFXN5	Q8TD22	340 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	WDR34	Q96EX3	536 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	MAP6	Q96JE9	813 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	FCRL1	Q96LA6	429 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	VDAC3	Q9Y277	283 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210		V9GYH0	126 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210		H3BML4	177 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	SELENOF	O60613	162 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	LIMS3	P0CW19	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	LIMS4	P0CW20	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	FOXL2	P58012	376 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	OCLN	Q16625	522 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ATCAY	Q86WG3	371 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	FAM60A	Q9NP50	221 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	CT62	P0C5K7	136 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ELK1	P19419	428 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	GRM7	Q14831	915 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ZNF613	Q6PF04	617 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ZNF550	Q7Z398	422 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	RDH10	Q8IZV5	341 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	HRK	O00198	91 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	ADRA2A	P08913	450 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	PTHLH	P12272	177 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	FPR3	P25089	353 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	CCR6	P51684	374 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	TEK	Q02763	1124 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210		E9PI62	339 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	REN	P00797	406 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	GPR89B	P0CG08	455 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	LCN1	P31025	176 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	PRKAR1B	P31321	381 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CUX1-215	ENST00000556210	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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