RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXO27Q8NI29 283 aa17.23■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRXN1Q9BYN0 137 aa17.23■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAP130Q9H0E3 1048 aa17.23■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC22A2O15244 555 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRLF1O75462 422 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DANCRP0C864 163 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UQCRBP14927 111 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IDUAP35475 653 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRISP3P54108 245 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FUT5Q11128 374 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSC22D1Q15714 1073 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAB1Q15750 504 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COX20Q5RI15 118 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CBLN3Q6UW01 205 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FRRS1Q6ZNA5 592 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FCRLAQ7L513 359 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIGWQ7Z7B1 504 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR119Q8TDV5 335 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ST8SIA1Q92185 356 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXW5Q969U6 566 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARMC7Q9H6L4 198 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SERINC1Q9NRX5 453 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VAPAQ9P0L0 249 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAM21Q9UKJ8 722 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CORO2BQ9UQ03 480 aa17.22■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLOCKO15516 846 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OIP5O43482 229 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NTN1O95631 604 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAP00813 363 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DBIP07108 87 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FESP07332 822 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL7RP16871 459 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHRNEQ04844 493 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FADDQ13158 208 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SELENBP1Q13228 472 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SKP2Q13309 424 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITGADQ13349 1161 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VEZF1Q14119 521 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 QPRTQ15274 297 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYPL1Q16563 259 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFAF6Q330K2 333 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPLX4Q7Z7G2 160 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKFN1Q8N957 763 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA3Q8NHX4 192 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR60Q8WVS4 1066 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFAF1Q9Y375 327 aa17.21■□□□□ 0.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C5orf58C9J3I9 102 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF223E7ERA6 249 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLIC1O00299 241 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBP2O00757 339 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOD3P08294 240 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BMP2P12643 396 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ETFAP13804 333 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRKCAP17252 672 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC7A1P30825 629 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAC3P60763 192 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNJ10P78508 379 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP1-1Q07627 177 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAPK11Q15759 364 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZSWIM7Q19AV6 140 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COQ5Q5HYK3 327 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF440Q8IYI8 595 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF563Q8TA94 476 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYLK2Q9H1R3 596 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COQ10BQ9H8M1 238 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCO1Q9HAY6 547 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLHL9Q9P2J3 617 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF232Q9UNY5 417 aa17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AGAP5A6NIR3 686 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EVPLLA8MZ36 301 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF814B7Z6K7 855 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANGPT2O15123 496 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHRM4P08173 479 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ENPP1P22413 925 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DMTNQ08495 405 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC25A53Q5H9E4 307 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C3orf33Q6P1S2 294 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q6ZT83 130 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OLIG3Q7RTU3 272 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC106Q9BWC9 280 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POTEKPQ9BYX7 375 aa17.19■□□□□ 0.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 REG4Q9BYZ8 158 aa17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms