RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	MED11	Q9P086	117 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	USP22	Q9UPT9	525 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		12.33	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CLDN24	A6NM45	220 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222		H0YC42	278 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ZNF264	O43296	627 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	OIP5	O43482	229 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	UBOX5	O94941	541 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CSTA	P01040	98 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	IGHV4-39	P01824	125 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	THBS1	P07996	1170 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	POU2F1	P14859	743 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	IL7R	P16871	459 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	DPP4	P27487	766 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	PGM1	P36871	562 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	KCNJ10	P78508	379 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SLC25A3	Q00325	362 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	PLAUR	Q03405	335 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ZNF117	Q03924	483 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	LIPE	Q05469	1076 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CBLN3	Q6UW01	205 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	VRK2	Q86Y07	508 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	KRT73	Q86Y46	540 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CMIP	Q8IY22	773 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	WNT2B	Q93097	391 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ZNF607	Q96SK3	696 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	PIGM	Q9H3S5	423 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	NDE1	Q9NXR1	346 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	IFT52	Q9Y366	437 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222		B2RBV5	119 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	HCRTR2	O43614	444 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	DNAJA2	O60884	412 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	AQP1	P29972	269 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	KCNJ5	P48544	419 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	GSK3B	P49841	420 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	P2RX1	P51575	399 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	MXRA7	P84157	204 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SKP2	Q13309	424 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	LIN52	Q52LA3	116 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	C16orf89	Q6UX73	402 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	CCDC80	Q76M96	950 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	MICU2	Q8IYU8	434 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	OR2T12	Q8NG77	320 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	FIG4	Q92562	907 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	HTRA1	Q92743	480 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	C1orf159	Q96HA4	380 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	TM9SF2	Q99805	663 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	BEX2	Q9BXY8	128 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	LAT2	Q9GZY6	243 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	ALG2	Q9H553	416 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-231	ENST00000552222	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44

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