RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PAMR1Q6UXH9 720 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 DHDDSQ86SQ9 333 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GGNQ86UU5 652 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 NFKBIDQ8NI38 313 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ZNF563Q8TA94 476 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TSPEARQ8WU66 669 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 FIG4Q92562 907 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MBD6Q96DN6 1003 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CGREF1Q99674 301 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TM9SF2Q99805 663 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ARMCX1Q9P291 453 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 A0A0G2JPF8 293 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 C7orf72A4D263 438 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GMNCA6NCL1 334 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SLC22A20A6NK97 555 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 DVL2O14641 736 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CXCL13O43927 109 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RCBTB2O95199 551 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PGM3O95394 542 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GKN3PP0CG01 181 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CCNA2P20248 432 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ME2P23368 584 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 LSP1P33241 339 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MTPNP58546 118 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GNGT1P63211 74 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CDK6Q00534 326 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MERTKQ12866 999 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GNA13Q14344 377 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PON3Q15166 354 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 HBMQ6B0K9 141 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CPLX4Q7Z7G2 160 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SNX32Q86XE0 403 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CDC20BQ86Y33 519 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 DPP10Q8N608 796 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 OR10D3Q8NH80 312 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TMEM234Q8WY98 164 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 OSTF1Q92882 214 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RASSF1Q9NS23 344 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 HIVEP2P31629 2446 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ZANQ9Y493 2812 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 A0A096LPE4 126 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PPZ6 126 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MRASO14807 208 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ADAMDEC1O15204 470 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 DNAJA2O60884 412 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 AQP8O94778 261 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 NTN1O95631 604 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RAF1P04049 648 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 DRD4P21917 467 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SLC6A2P23975 617 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 AQP1P29972 269 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 HOXC12P31275 282 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SLC6A8P48029 635 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 DLX5P56178 289 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CARD18P57730 90 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SCARB2Q14108 478 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 KEAP1Q14145 624 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ADRM1Q16186 407 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PDSS1Q5T2R2 415 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 REP15Q6BDI9 236 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 REEP3Q6NUK4 255 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms